三轴点胶机采用的控制系统主要有PLC控制系统和PC控制系统两种。PLC控制系统是一种可编程逻辑控制器，它具有稳定性强、反应速度快、抗干扰能力强等特点，适用于简单、固定的点胶工艺。PLC控制系统可以通过逻辑控制对点胶机的运行进行灵活的控制，能够满足基本的生产需求，操作简便，适用性强。但是，PLC控制系统的功能有限，不适合处理复杂的点胶工艺。
另一种控制系统是PC控制系统，它采用个人电脑作为控制核心，利用计算机的强大处理能力和丰富的功能模块，可以实现更加复杂、精细的点胶控制。PC控制系统可以通过软件编程实现各种复杂的点胶轨迹规划、速度控制、压力控制等功能，同时还可以实现数据采集、分析和远程监控等功能，具有很高的灵活性和扩展性。PC控制系统还能够方便的与其它设备进行数据交换和通信，实现生产线的智能化和自动化。
PC控制系统相比于PLC控制系统也存在一些缺点，例如稳定性不如PLC控制系统那么高，对环境的要求也更为严格，同时成本也相对较高。因此在选择适合自己生产需求的三轴点胶机控制系统时，需要综合考虑生产工艺复杂度、成本预算、对稳定性和精度的要求等因素，选择最适合的控制系统。
PLC控制系统适合简单、固定的点胶工艺，具有稳定性和易操作性等优点；而PC控制系统则适合复杂、精细的点胶工艺，具有高度的灵活性和扩展性。在选择三轴点胶机控制系统时，应根据生产需求和预算情况综合考虑，选择最合适的控制系统。