清洗系统是全自动涂覆机中至关重要的部分，设计合理的清洗系统能够确保涂覆机长时间稳定运行。清洗系统应当具备自动清洗功能，能够根据设定的时间间隔或涂覆次数自动启动清洗程序。这样可以确保设备在连续运行时保持清洁，避免残留物堵塞管道或影响涂覆质量。清洗系统还要具备手动清洗功能，操作人员可以根据需要随时启动清洗程序，对设备进行全面清洗。
清洗系统的设计还需要考虑到清洗效率和节水节能。为了提高清洗效率，可以在清洗系统中添加多个喷嘴或旋转喷头，确保涂料可以被彻底清洗掉。可以在清洗系统中加入加热装置，提高清洗液的温度，加快清洗速度。为了节约水资源，可以设计循环利用清洗液的系统，将清洗液收集起来再次利用，减少水的消耗。还可以在清洗系统中添加水位传感器和自动加药装置，根据清洗液的浓度自动进行加药，确保清洗效果的同时减少清洗液的使用。
清洗系统的设计需要考虑清洗液的排放和处理。可以在涂覆机下方设计一个集液槽，收集清洗过程中产生的废液，避免液体外溢或污染环境。为了方便处理废液，可以在集液槽中设置浮球开关或液位传感器，当液位达到一定高度时自动报警或停止清洗程序。可以设计废液处理装置，对废液进行沉淀、过滤或其他处理，确保废液符合排放标准，同时减少对环境的污染。
清洗系统的安全性也是设计的重要考虑因素之一。可以在清洗系统中设置安全门和急停按钮，确保操作人员在清洗过程中能够及时停止设备并避免意外发生。清洗系统的电路设计应符合国家标准，确保设备稳定可靠。还可以在清洗系统中设置故障检测装置和报警系统，对设备的运行状态进行实时监测，及时发现并处理故障，确保设备长时间安全运行。