三轴点胶机的控制系统是由硬件和软件两部分组成的。硬件包括主控制板、驱动器、运动控制卡、传感器等。主控制板是整个系统的核心，负责数据的处理和指令的发送；驱动器则负责控制各个轴的运动，保证点胶机能够按照设定的轨迹准确地进行点胶操作；运动控制卡则是连接主控制板和驱动器之间的桥梁，起到协调作用；传感器用来检测工件的位置、速度等信息，为系统提供反馈。
软件部分则是指控制系统的程序，通过预先设定的点胶参数、路径等信息，控制硬件部分的工作。软件通常包括人机界面、运动控制程序、算法控制等几个部分。人机界面是用户与点胶机之间的交互平台，用户可以通过界面设置点胶参数、路径等信息；运动控制程序则是根据用户设定的参数，控制各个轴的运动，实现点胶操作；算法控制部分则是根据特定的算法，对点胶过程进行优化、调整，以实现更加精准的点胶效果。
三轴点胶机的控制系统采用闭环控制，即通过不断的反馈调整，保证点胶过程中的精度和稳定性。闭环控制系统通常包括传感器、采集模块、控制器和执行机构等组成。传感器负责采集实时的位置、速度等信息，将数据传输给控制器；控制器则根据反馈信息，通过控制执行机构实现对点胶过程的调节和控制。闭环控制系统能够及时纠正误差，保证点胶机在不同工况下的稳定性和精度。
除了基本的硬件和软件控制系统之外，三轴点胶机还可以配备视觉识别系统。视觉识别系统可以通过摄像头等设备，实时地捕捉工件的图像，再通过图像处理算法，分析出工件的特征和位置信息，从而实现对点胶过程的实时监控和调整。视觉识别系统的引入，可以提高点胶的精度和适用范围，满足更多不同工件的点胶需求。